Нужно сделать следующее: во всех подпапках указанной папки взять все аудио-файлы, перекодировать их с указанными настройками и сохранить в то же место, а исходные удалить.

Есть такая прога? Пробовал всякое - от мелких программулин до Неро - либо искать в подпапках не умеют, либо требуют задать путь для сохранения. Не хотелось бы вручную - уж очень много подпапок имеется, каждую отдельно перекодировать - умереть можно.

Подскажите, может кто-нибудь сталкивался с такой программой?

Попробуй MediaMonkey

Вот что тебе надо Easy CD-DA Extractor