У меня стоит Vista Ultimate, устанавливал программы вышло сообщение о
несовместимости, потом что нарушена структура диска просила запустить
CKDISK, после перезагрузки исчезла папка Program Files и многие файлы,
подскажите что предпринять?

А откат не пробовал делать?

пишет установка запрещена политикой,заданной системным администратором

Установка чего?
Дык, зайди из-под админа и настрой политику...
Честно говоря, это что-то новенькое (чтоб откат был запрещен)...