При уверенном приеме PCI плата конечно лучше, хотя бы тем, что реже отваливается от сети и,обычно, быстрее работает...
USB лучше когда прием неравномерный - где-то есть , а где-то вообще нет, и системник нельзя поставить в ту зону с уверенным приемом... Здесь эти "флешки" незаменимы...
Но есть одно НО! USB любит отваливаться от сети, причем чем длинее удлинитель, тем больше вероятность, что будет "лагать".
Опять же все зависит от конкретной ситуации...
Лично я бы сначала взял обе где-то ( в офисе, у друзей и т.п.) , а еще лучше несколько моделей разных производителей и поэксперементировал в конкретной квартире, а только потом принимал решение о покупке...
P.S. В моей практике приходилось менять роутер - адаптер ноутбука не хотел работать с купленным без эксперимента роутером - мощности сигнала не хватало, квартира большая оказалась...